El Síndrome de Fatiga Crónica o encefalomielitis miálgica (SFC/EM) es una enfermedad compleja y debilitante caracterizada por una fatiga extrema no aliviada con descanso, malestar post-esfuerzo (PEM), disfunción cognitiva, trastornos del sueño y diversos síntomas neurológicos, inmunes y autonómicos. A pesar de su impacto, su diagnóstico sigue siendo clínicamente desafiante por la ausencia de marcadores únicos y objetivos. Sin embargo, en los últimos años, la metabolómica por espectrometría de masas ha permitido descubrir alteraciones bioquímicas medibles, especialmente en los perfiles de ácidos orgánicos en orina.
¿Qué son los ácidos orgánicos?
Los ácidos orgánicos son metabolitos intermedios de diversas rutas bioquímicas del organismo, incluyendo la glucólisis, el ciclo de Krebs, la ß-oxidación de los ácidos grasos, el metabolismo de aminoácidos y las vías de detoxificación hepática. Se eliminan mayoritariamente por la orina, y su análisis cuantitativo mediante cromatografía acoplada a espectrometría de masas (GC-MS o LC-MS/MS) permite obtener una «huella bioquímica» del metabolismo celular.
Utilidad del análisis de ácidos orgánicos en el SFC
Diversos estudios han mostrado que los pacientes con SFC/EM presentan patrones recurrentes de alteración en estos metabolitos. Estos patrones reflejan alteraciones energéticas, disfunción mitocondrial, desequilibrio redox y activación inmune crónica. La interpretación de estos perfiles permite no solo apoyar el diagnóstico, sino también individualizar el tratamiento.
Hallazgos científicos clave
1. Estado hipometabólico (Naviaux et al., 2016)
Uno de los estudios más citados, realizado por Naviaux y col., identificó un fenotipo hipometabólico en SFC/EM similar al estado de dauer en nematodos, caracterizado por una reducción global de la actividad metabólica. Se encontraron disminuciones en metabolitos del ciclo de Krebs, fosfolípidos, esfingolípidos y purinas.
2. Inhibición de la piruvato deshidrogenasa (Fluge et al., 2016)
Este estudio demostró que los pacientes con SFC tienen una inhibición funcional de la enzima PDH, lo que bloquea la conversión de piruvato en acetil-CoA, paso clave para la entrada de glucosa al ciclo de Krebs. Como resultado, se acumula piruvato y lactato.
3. Disfunción del ciclo de Krebs (Armstrong et al., 2015)
Se observó una acumulación de metabolitos como ácido láctico, succinato, ácido málico y pirúvico, junto con disminuciones en isocitrato, indicando un ciclo de Krebs lento o bloqueado.
4. Malestar post-esfuerzo y alteraciones energéticas (McGregor et al., 2021)
Se describieron aumentos post-esfuerzo de ácido pirúvico, succinato y málico, con caídas compensatorias en citrato e isocitrato. Esto apoya el uso de pruebas de esfuerzo y análisis metabolómico para objetivar el PEM.
5. Otros estudios relevantes
- Yamano et al., 2016: Disminuciones en ciclo de urea y Krebs. https://www.nature.com/articles/srep34990
- Missailidis et al., 2021: Alteraciones en glutatión, carnitina y CoQ10. https://www.mdpi.com/2218-1989/11/4/219
- Liang et al., 2019: Firma metabólica en plasma que permite distinguir SFC de controles. https://www.nature.com/articles/s41398-019-0581-3
- Germain et al., 2020: Disfunción en esteroides y lípidos acilados. https://www.mdpi.com/2218-1989/10/1/34
Metabolitos más frecuentemente alterados en SFC/EM
- Piruvato ↑
- Lactato ↑
- Ácido málico ↑
- Isocitrato ↓
- Succinato ↑
- Alfa-cetoglutarato ↓ o ↑ (según el estadio)
- Glutatión reducido (GSH) ↓
- Carnitina total y libre ↓
- Coenzima Q10 ↓

Aplicación clínica de los test de ácidos orgánicos
El análisis de ácidos orgánicos en orina ofrece una herramienta no invasiva para detectar muchas de estas alteraciones. En el contexto del SFC/EM, los perfiles de orina pueden mostrar:
- Elevación de piruvato, ácido málico, tartárico y paracresol
- Disminución de intermediarios del ciclo de Krebs como isocitrato, oxalato, glucárico o marcadores musculares como 3-metilhistidina
- Correlaciones con disbiosis intestinal, déficit de cofactores mitocondriales y estrés oxidativo
Conclusión
Los estudios basados en espectrometría de masas han proporcionado evidencia objetiva de que el SFC/EM implica alteraciones metabólicas profundas y medibles. La metabolómica, y en especial el análisis de ácidos orgánicos en orina, representa una herramienta valiosa tanto para apoyar el diagnóstico como para individualizar estrategias terapéuticas. A medida que crece la investigación, es previsible que estos biomarcadores se incorporen de forma estándar en el abordaje clínico del SFC/EM.
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